В 1980-х годах в стране произошло сворачивание энергоёмких и материалоёмких производств в рамках структурной перестройки промышленности с целью снижения её зависимости от импорта сырья и топлива. Своеобразная черта японской экономики — сочетание крупных концернов с большим числом мелких предприятий. Гигантские монополии (в том числе «Mitsubishi», «Mitsui», «Sumitomo», «Fuji», «Sanwa» и другие) контролируют почти все отрасли экономики.
В стране длительное время существовала «система пожизненного найма», когда работнику нельзя было переходить из одной фирмы в другую. Если он решался это сделать, то его считали предателем и относились к нему пренебрежительно.
Япония вложила много средств в строительство дорог. Основным средством передвижения является автотранспорт, использующий около 1,2 млн км. мощённых дорог. В Японии левостороннее движение. Единая сеть высокоскоростных платных дорог связывает крупные города страны. Налоги для владельцев автомобилей и налоги на топливо используются для поощрения экономичных технологий.
Десятки железнодорожных компаний конкурируют на национальном и региональных рынках, например, 7 компаний Японских железных дорог, Kintetsu, Seibu Railway и Keio Corporation. Около 250 скоростных поездов синкансэн соединяют главные города страны. Японские машинисты известны своей пунктуальностью.
В Японии 173 аэропорта. Полёты — популярный способ передвижения. Крупнейший национальный аэропорт — Международный аэропорт Токио — является вторым по загруженности аэропортом Азии. Крупнейшие международные аэропорты включают в себя Нариту, Кансай и Тюбу, а крупнейшим портом является порт Нагои.